Yiğit Ali Ekmekci, Nesin Vakfı ve İstanbul Bilgi Üniversitesi gibi birçok eğitim kurumunun kurucu üyesidir ve Türkiye'deki birçok sivil toplum oluşumunun aktif bir üyesi ve destekçisidir. Şu anda Anadolu Kültür yönetim kurulu başkan vekilliği ve Terakki Vakfı Okulları'nda yönetim kurulu üyeliği görevlerini üstenmektedir.
Türkiye’de insan hakları savunucuları, yargısal taciz dahil olmak üzere cezai kovuşturmalar, fiziksel saldırılar, tehditler, gözetim altında tutulma, uzun süreli keyfi gözaltı ve kötü muameleye maruz kalıyorlar. Temmuz 2016’da gerçekleşen darbe girişimi sonrası insan hakları savunucularının faaliyetlerini sürdürdükleri ortam daha da kötü bir hale geldi.
